Администрация ГОУ СПО БМУ постоянно проводит работу по социальной защите студентов. Взяты на учет студенты-сироты, студенты из малообеспеченных семей, такой категории лиц выплачивается социальная стипендия. В течение учебного года студенты, занимающиеся на «4» и «5» получают ежемесячную повышенную стипендию. Студенты, активно участвующие в общественной работе, принимающие участие в работе предметных кружков, во внеклассных мероприятиях, а так же в спортивных соревнованиях имеют различные поощрения, грамоты, сертификаты.

С 2004 г., раз в два года, студенты ГОУ СПО БМУ, из числа отличников, представляются к губернаторской стипендии Забайкальского края.